Сергей (es3000),
Вы сказали, что у вас есть 3 уровня задач:
1. Цели
2. Стратегические задачи
3. Элементарные задачи
Они связаны между собой? Например, можно понять, какая элементарная задача относится к стратегической и как стратегическая связана с целью?
Если да, то можно воспользоваться системой ранжирования
MoSCoW, но это надо делать с бизнесом обязательно:
1. Ранжируем Цели по MoSoW, в каждой группе д.б. примерно одинаковое кол-во задач
2. Берем М из целей и ранжируем Стратегические по MoSoW
3. Берем М из Стратегических и ранжируем Элементарные по MoSoW
4. Решаем М из элементарных, оставляем запас для срочных задач
5. Далее повторяем все сначала, т.к. за это время приоритеты могут поменяться
Если нет, то нужно привести к строгому соответствию Цель-СтатегЗадача-ЭлементЗадача, проставив каждой задаче свой тип.