попробуйте для себя сравнить не набор тем, а творческий коллектив преподавателей той и другой кафедры. И идите к тем, кто Вам ближе по духу. Понимаю, что на втором курсе эту информацию часто получить сложно, но можно, например, пообщаться со старшекурсниками, посмотреть темы работ той и другой кафедры, напроситься на защиты НИРа, студенческие семинары (должны быть).